Instalacje pomp ciepła nadal są bardzo drogie, koszt najtańszej instalacji tego typu nie zwróci się podczas użytkowania urządzenia. Kolejną wadą jest konieczność zasilania pompy energią elektryczną. Roczny koszt zużycia energii elektrycznej do obsługi pompy ciepła jest zbliżony do wydatków na węgiel potrzebny do ogrzewania danego budynku w ciągu jednego sezonu. W porównaniu z kotłem na ekogroszek, inwestycja w pomę ciepła nie zwróci się nigdy, jeżeli przyjmujemy do kalkulacji obecny stosunek ceny węgla do ceny energii elektrycznej. Koszty inwestycji i zasilania pompy to jedyna, ale poważna wada tego rozwiązania.

Poza tym urządzenia są bezobsługowe, całkowicie zautomatyzowane i precyzyjnie sterowane. Nie ponosi się, żadnych kosztów na paliwo, ponieważ pompa zasilana jest przez ciepło ziemi (pompa gruntowa) lub powietrza nawet o ujemnej temperaturze (pompa powietrzna).